第一处，袁承志准备和玉真子作生死决斗之时，阿九递上金蛇剑，连载版和修订版在此处的描写恰到好处——
袁承志斗然见到了她，不觉一怔。阿九低声道：“你……你……”语音哽咽，说不下去了。袁承志接过宝剑，阿九倏地退开。
新修版中，由于前文已经添加了两人情窦深种的情节，因此在这里是这样写的——
自袁承志出场，阿九一双妙目就一直凝望着他，见他便要与玉真子放对，她刚才见到玉真子武功高明之极，知道这一战存亡决于俄顷，说不定就此生死永别，斜身走上几步，说道：“大哥，我好好的在这里，手臂上的伤也好了。”她知袁承志对己钟情甚深，怕他心中还记挂着自己，以致与大敌对决时未能专注。袁承志陡然间见到了她，转头向躺在何惕守怀里的青青望了一眼，一声长叹，说道：“你一定要好好保重……”对何惕守道：“惕守，请你照顾她平安。”何惕守眼光中闪烁着狡狯的神色，问道：“师父，你要我照顾谁啊？”她心中想：“师父三心两意，好像钟情夏家青青，又对朱家阿九含情脉脉。他如叫我照顾阿九，那是说他自己会照顾青青。他如叫我照顾的是青青，那么他自己会照顾阿九妹子了。”神色之间，颇有妖媚俏态。
玉真子瞧在眼里，不禁叫道：“师父徒弟，打情骂俏，成什么样子！”
此处的修改有画蛇添足之嫌，虽然作者是为了描写袁承志和阿九两人的情感，但大战在即，居然还顾得上儿女情长，不合常理。再联系全书袁承志在阿九和青青两人之间的纠缠不清，显得此人十分优柔寡断，婆婆妈妈。
第二处，袁承志在和玉真子生死相搏的过程当中，突然分心，连载版和修订版中说的是，他瞥到原本重伤难治的青青已经获救，心中大喜。这种分心是情有可原的。
而新修版中不嫌繁琐地多加了几段——
承志一瞥眼间见到青青，又见到阿九，心念忽动：“这两个姑娘对我都是一片真情，并非假意。到底我心中对谁更加好些？我识得青弟在先，曾说过要终生对她爱护，原不该移情别恋，可是一见阿九之后，我这颗心就转到这小妹妹身上了。整日价总是想着她多，想着青弟少。我内心盼望的，其实是想跟阿九一生一世的在一起，永不离开。到底如何是好？”
日光斜照，从树枝间映向阿九脸颊，承志凝望她的玉容丽色，一时竟然痴了，脚步渐渐向她靠近，猛地惊觉：“什么叫做‘意假情真’？我爱了这人，全是真情，自然心意也是真的。唉！当年金蛇郎君对待何红药，最初当是真情真意，后来跟青弟的妈妈相处久了，竟然情与意都变了。袁承志啊袁承志，你也是个无情无义的家伙！”可是眼光要从阿九脸上转向青青，竟自不能，气血上涌，只想扑到阿九身上，紧紧抱住了她，就让玉真子将两人一剑同时斩死，就此解此死结。
由于袁承志心神不宁，几乎要被玉真子毙于剑下，幸亏阿九舍命相救，随后两人更是旁若无人地抱在一起，玉真子实在不能忍，喝道：“卿卿我我，够了吗？”
这里的修改更加画蛇添足，而且更加地不合情理。即便是琼瑶戏里，尔康也要打退敌人之后再和紫薇卿卿我我吧，难怪玉真子受不了。
接下来有一处小改动，袁承志单手抱着阿九，使出一招“意假情真”，和杨过的“黯然销魂掌”十分类似，大出对手的意料，一举奏功。而在旧的两版中，是青青放出毒蛇，将玉真子咬死。这一处改动则是见仁见智了。
第三处严重不妥的地方，是李岩的夫人红娘子狼狈不堪地赶来求救，袁承志大急，叫道：“咱们快去救，迟一步只怕来不及了！”随后华山派匆忙立定新掌门人。接下来连载版中如是写道——
承志见大事已了，悬念义兄，叩别师父就要下山，对青青道：“青弟，你在这里休养，我救出义兄后回头再来瞧你。”青青见阿九也跟上山来，心中愈加气愤，眼圈一红，流下泪来。阿九突然走到青青跟前，黯然说道：“青姊姊，你不再恨我了吧？”伸手拉下皮帽，露出一个光头，原来她父丧国亡，又知道了承志对青青的一片情意，心灰意懒，就此削发为尼。众人见她如此，都大感意外，青青更是心中惭愧，承志心乱如麻，不知如何是好。木桑忽道：“这位姑娘适才救我性命，老道一生未收徒弟，现在我门户已清，如不嫌弃，授你几手功夫如何？”阿九脸露喜色，过去盈盈拜倒，后来她尽得木桑绝艺，成为清初一代大侠，日后甘凤池、白泰官、吕四娘著名英侠等都出自她的门下，这是后话。
修订版中基本相同，接着大家匆忙下山，一切都显得很紧凑。
而新修版则大幅修改，加入了青青哭着和袁承志争辩，随后竟然跳崖自尽的情节。自然地，袁承志舍命相救。这一切阿九看在眼里，一番深思，彷徨不决，木桑道人了然于心，索性收阿九为徒，带她远赴藏边。阿九对袁承志说，等他三年，三年不来，就落发为尼。
接下来袁承志忙着照顾青青，又是一通意乱情迷，犹豫不定，何惕守则不住规劝......救义兄李岩的事，已经被袁承志抛到九霄云外了。直到次日，大家才出发下山。
救人如救火，红娘子已经心急火燎了，袁承志还在纠结儿女情愫，似乎毫不将义兄的安危放在心上。金庸凭空加入这么一大段，有点不近人情啊。
这一处修改，是最受诟病的。
《碧血剑》结尾的以上三处修改，可以看出作者的总体思路，就是要给角色加入更多的感情戏，或者说苦情戏。这种思路在《书剑恩仇录》结尾多加的一章中，已经体现得很明显，在后面的射雕、天龙等书中仍会继续展现。
